Q1. 여기서 input은 생산에 필요한 투입을 의미합니다. 비료나 씨앗 등을 의미하는데 인위적으로 만든 것이 아니라 유기농을 쓴다고 말하고 있어요!

Q2. 바로 뒤에 나오는 문장에서 (because~) 유기농 질소 물질 활용이 제한적이고 더 비싸기 때문에 비 유기농 질소 활용 (인위적인 질소)이 필수적이라고 하는 겁니다. 또한 앞에 나오는 However가 글의 방향을 바꿔 놓습니다. 유기농 (+) > 마냥 (+)는 될 수 없음을 나타냅니다.

Q3. 유기농 질소는 제한적이고 비쌉니다. 그래서 비 유기농 질소를 쓸 수 밖에 없습니다. 게다가 (in addition) (여기서 이미 화자의 글쓰는 방향이 바뀌었습니다. 유기농은 비싸고 대가가 있다는 것을 의미하고 있습니다) green(유기농)거름 작물들에 대한 광범위한 사용이 benefit(?) 여기서 말이 안됩니다. 이미 의견이 넘어간 상황이랑 benefit이 아니라 부정적인 견해 혹은 의문이 든다는 단어가 나와야 합니다.

그래서 답이 3번 입니다.

질문 학생 말대로 '2번과 3번이 같은 얘기를 하고 있으니 연결성이 있는 것 아닌가'에 대한 답변을 드리면 아까도 설명했던 것 처럼 위에 However (직접 세모를 쳤던) 부분이 설명이 되지 않습니다. 이미 거기서 흐름이 바뀌었다는 것을 인지한 뒤 글을 읽는 것이 중요한 포인트 였습니다.

게다가 because 부분도 중간을 단절 시켜 놓기도 합니다. 즉, 인과관계가 여기서 이미 깨지는 상황입니다.